Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbcbQ9D1E6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbcbQ9D1E6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms