Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms