Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem53Q9D0Z3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms