Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc7Q9D0M0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms