Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Zbed3Q9D0L1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Zbed3Q9D0L1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Zbed3Q9D0L1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Zbed3Q9D0L1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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