Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NkapQ9D0F4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms