Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms