Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MtrexQ9CZU3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MtrexQ9CZU3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms