Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms