Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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