Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rex1bdQ9CYZ6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms