Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms