Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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