Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs4Q9CXZ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms