Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf1Q9CWX2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms