Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pin4Q9CWW6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pin4Q9CWW6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pin4Q9CWW6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pin4Q9CWW6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pin4Q9CWW6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pin4Q9CWW6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms