Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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