Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NubplQ9CWD8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms