Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms