Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms