Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pard3bQ9CSB4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard3bQ9CSB4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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