Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms