Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms