Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms