Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms