Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms