Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms