Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms