Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sar1bQ9CQC9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms