Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms