Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc5Q9CQA1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc5Q9CQA1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc5Q9CQA1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc5Q9CQA1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc5Q9CQA1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trappc5Q9CQA1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trappc5Q9CQA1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trappc5Q9CQA1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trappc5Q9CQA1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc5Q9CQA1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms