Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms