Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc18Q9CQ07 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms