Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms