Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms