Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms