Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup155Q99P88 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms