Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms