Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem2Q99NH8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms