Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl3Q99N95 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl3Q99N95 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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