Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms