Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd1Q99MV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms