Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms