Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms