Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pagr1aQ99L02 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms