Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf34Q99KR6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms