Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms