Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms