Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf11Q99JX1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms