Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lims1Q99JW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lims1Q99JW4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lims1Q99JW4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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